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快捷方式

保存 TensorDict 和 tensorclass 对象

虽然我们可以直接使用 save() 来保存 tensordict,但这会创建一个包含整个数据结构内容的文件。可以很容易地想象到某些情况下的效率不高!

TensorDict 的序列化 API 主要依赖于 MemoryMappedTensor,它被用来独立地将张量写入磁盘,并使用一个模仿 TensorDict 结构的数据结构。

TensorDict 的序列化速度可能比 PyTorch 的 save() (依赖于 pickle)快一个数量级。本文档将解释如何使用 TensorDict 创建和交互存储在磁盘上的数据。

保存内存映射的 TensorDict

当 tensordict 被转储为 mmap 数据结构时,每个条目对应一个单独的 *.memmap 文件,目录结构由键结构决定:通常,嵌套键对应子目录。

将数据结构保存为结构化的内存映射张量集合具有以下优点:

  • 保存的数据可以部分加载。如果一个大型模型已保存到磁盘,但只需要将其中一部分权重加载到单独脚本中创建的模块中,那么只有这些权重会被加载到内存中。

  • 保存数据是安全的:使用 pickle 库序列化大型数据结构可能不安全,因为反序列化会执行任意代码。TensorDict 的加载 API 只读取保存的 json 文件和磁盘上保存的 memorybuffer 中预先选定的字段。

  • 保存速度快:因为数据被写入多个独立的文件,我们可以通过启动多个并发线程来分摊 IO 开销,每个线程都可以访问自己的专用文件。

  • 保存数据的结构很明显:目录树指示了数据的内容。

但是,此方法也有一些缺点:

  • 并非所有数据类型都可以保存。tensorclass 允许保存任何非张量数据:如果这些数据可以在 json 文件中表示,则会使用 json 格式。否则,非张量数据将作为回退,通过 save() 独立保存。可以使用 NonTensorData 类在常规 TensorDict 实例中表示非张量数据。

tensordict 的内存映射 API 依赖于四个核心方法:memmap_()memmap()memmap_like()load_memmap()

memmap_()memmap() 方法将数据写入磁盘,是否修改包含数据的 tensordict 实例。这些方法可用于序列化模型到磁盘(我们使用多个线程来加快序列化速度)。

>>> model = nn.Transformer()
>>> weights = TensorDict.from_module(model)
>>> weights_disk = weights.memmap("/path/to/saved/dir", num_threads=32)
>>> new_weights = TensorDict.load_memmap("/path/to/saved/dir")
>>> assert (weights_disk == new_weights).all()

memmap_like() 用于需要预分配到磁盘的数据集,典型用法为:

>>> def make_datum(): # used for illustration purposes
...    return TensorDict({"image": torch.randint(255, (3, 64, 64)), "label": 0}, batch_size=[])
>>> dataset_size = 1_000_000
>>> datum = make_datum() # creates a single instance of a TensorDict datapoint
>>> data = datum.expand(dataset_size) # does NOT require more memory usage than datum, since it's only a view on datum!
>>> data_disk = data.memmap_like("/path/to/data")  # creates the two memory-mapped tensors on disk
>>> del data # data is not needed anymore

如上所示,在将 `TensorDict` 的条目转换为 `MemoryMappedTensor` 时,可以控制内存映射在磁盘上的保存位置,以便它们可以持久化并稍后加载。另一方面,也可以使用文件系统。要使用此功能,只需在上述三个序列化方法中省略 `prefix` 参数。

当指定了 `prefix` 时,数据结构遵循 TensorDict 的结构。

>>> import torch
>>> from tensordict import TensorDict
>>> td = TensorDict({"a": torch.rand(10), "b": {"c": torch.rand(10)}}, [10])
>>> td.memmap_(prefix="tensordict")

会产生以下目录结构:

tensordict
├── a.memmap
├── b
│   ├── c.memmap
│   └── meta.json
└── meta.json

meta.json 文件包含重建 tensordict 的所有相关信息,例如设备、批量大小,以及 tensordict 的子类型。这意味着 load_memmap() 将能够重构复杂的嵌套结构,其中子 tensordict 的类型与父级不同。

>>> from tensordict import TensorDict, tensorclass, TensorDictBase
>>> from tensordict.utils import print_directory_tree
>>> import torch
>>> import tempfile
>>> td_list = [TensorDict({"item": i}, batch_size=[]) for i in range(4)]
>>> @tensorclass
... class MyClass:
...     data: torch.Tensor
...     metadata: str
>>> tc = MyClass(torch.randn(3), metadata="some text", batch_size=[])
>>> data = TensorDict({"td_list": torch.stack(td_list), "tensorclass": tc}, [])
>>> with tempfile.TemporaryDirectory() as tempdir:
...     data.memmap_(tempdir)
...
...     loaded_data = TensorDictBase.load_memmap(tempdir)
...     assert (loaded_data == data).all()
...     print_directory_tree(tempdir)
tmpzy1jcaoq/
    tensorclass/
        _tensordict/
            data.memmap
            meta.json
        meta.json
    td_list/
        0/
            item.memmap
            meta.json
        1/
            item.memmap
            meta.json
        3/
            item.memmap
            meta.json
        2/
            item.memmap
            meta.json
        meta.json
    meta.json

处理现有的 `MemoryMappedTensor`

如果 `TensorDict` 已包含 `MemoryMappedTensor` 条目,则有几种可能的行为。

  • 如果未指定 `prefix` 并且两次调用 `memmap()`,则生成的 `TensorDict` 将包含与原始数据相同的数据。

    >>> td = TensorDict({"a": 1}, [])
    >>> td0 = td.memmap()
    >>> td1 = td0.memmap()
    >>> td0["a"] is td1["a"]
    True
    
  • 如果指定了 `prefix` 并且与现有 `MemoryMappedTensor` 实例的 `prefix` 不同,则会引发异常,除非传递了 `copy_existing=True`。

    >>> with tempfile.TemporaryDirectory() as tmpdir_0:
    ...     td0 = td.memmap(tmpdir_0)
    ...     td0 = td.memmap(tmpdir_0)  # works, results are just overwritten
    ...     with tempfile.TemporaryDirectory() as tmpdir_1:
    ...         td1 = td0.memmap(tmpdir_1)
    ...         td_load = TensorDict.load_memmap(tmpdir_1)  # works!
    ...     assert (td_load == td).all()
    ...     with tempfile.TemporaryDirectory() as tmpdir_1:
    ...         td_load = TensorDict.load_memmap(tmpdir_1)  # breaks!
    

    此功能旨在防止用户无意中将内存映射的张量从一个位置复制到另一个位置。

TorchSnapshot 兼容性

警告

由于 torchsnapshot 的维护已停止。因此,我们不会为 tensordict 与该库的兼容性实现新功能。

TensorDict 与 PyTorch 的检查点库 torchsnapshot 兼容。TorchSnapshot 将独立保存您的每个张量,其数据结构模仿您的 tensordict 或 tensorclass 的结构。此外,TensorDict 已内置了在不将完整张量加载到内存的情况下,保存和加载大型数据集的工具:换句话说,tensordict + torchsnapshot 的组合使得可以将一个大小为数百 GB 的张量加载到预先分配的 `MemmapTensor` 中,而无需将其作为一个大块加载到 RAM 中。

主要有两种用例:保存和加载适合内存的 tensordict,以及使用 `MemmapTensor` 保存和加载存储在磁盘上的 tensordict。

通用用例:内存加载

如果目标 tensordict 未预先分配,则此方法适用。它提供了灵活性(您可以将任何 tensordict 加载到您的 tensordict 中,无需提前了解其内容),并且此方法的编码比其他方法稍微简单一些。但是,如果您的张量非常大且不适合内存,此方法可能会失败。此外,它不允许您直接加载到您选择的设备上。

保存操作需要记住的两个主要命令是:

>>> state = {"state": tensordict_source}
>>> snapshot = torchsnapshot.Snapshot.take(app_state=state, path="/path/to/my/snapshot")

要加载到目标 tensordict,您可以直接加载快照并更新 tensordict。在此底层,此方法将调用 `tensordict_target.load_state_dict(state_dict)`,这意味着 `state_dict` 将首先完全加载到内存中,然后加载到目标 tensordict。

>>> snapshot = Snapshot(path="/path/to/my/snapshot")
>>> state_target = {"state": tensordict_target}
>>> snapshot.restore(app_state=state_target)

这是一个完整的示例:

>>> import uuid
>>> import torchsnapshot
>>> from tensordict import TensorDict
>>> import torch
>>>
>>> tensordict_source = TensorDict({"a": torch.randn(3), "b": {"c": torch.randn(3)}}, [])
>>> state = {"state": tensordict}
>>> path = f"/tmp/{uuid.uuid4()}"
>>> snapshot = torchsnapshot.Snapshot.take(app_state=state, path=path)
>>> # later
>>> snapshot = torchsnapshot.Snapshot(path=path)
>>> tensordict2 = TensorDict()
>>> target_state = {
>>>     "state": tensordict2
>>> }
>>> snapshot.restore(app_state=target_state)
>>> assert (tensordict == tensordict2).all()

保存和加载大型数据集

如果数据集太大而无法放入内存,上述方法可能会轻易失败。我们利用 torchsnapshot 的功能,将张量分块加载到其预先分配的目的地。这需要您知道目标数据将具有什么形状、设备等,并且数据将驻留在何处,但这是能够检查点您的模型或数据加载的一个小小的代价!

与前面的示例相比,我们将不使用 `TensorDict` 的 `load_state_dict()` 方法,而是使用从目标对象获取的 `state_dict`,并用保存的数据重新填充它。

同样,只需两行代码即可保存数据:

>>> app_state = {
...     "state": torchsnapshot.StateDict(tensordict=tensordict_source.state_dict(keep_vars=True))
... }
>>> snapshot = torchsnapshot.Snapshot.take(app_state=app_state, path="/path/to/my/snapshot")

我们使用了 `torchsnapshot.StateDict`,并明确调用了 `my_tensordict_source.state_dict(keep_vars=True)`,这与前面的示例不同。现在,要将其加载到目标 tensordict:

>>> snapshot = Snapshot(path="/path/to/my/snapshot")
>>> app_state = {
...     "state": torchsnapshot.StateDict(tensordict=tensordict_target.state_dict(keep_vars=True))
... }
>>> snapshot.restore(app_state=app_state)

在此示例中,加载完全由 torchsnapshot 处理,即没有调用 `TensorDict.load_state_dict()`。

注意

这有两个重要的含义:

  1. 由于 `LazyStackedTensorDict.state_dict()`(以及其他懒惰 tensordict 类)在执行某些操作后返回数据的副本,因此加载到 state_dict 不会更新原始类。但是,由于支持 `state_dict()` 操作,因此不会引发错误。

  2. 同样,由于 state_dict 是就地更新的,但 tensordict 没有使用 `TensorDict.update()` 或 `TensorDict.set()` 进行更新,因此目标 tensordict 中缺少键将不会被注意到。

这是一个完整的示例:

>>> td = TensorDict({"a": torch.randn(3), "b": TensorDict({"c": torch.randn(3, 1)}, [3, 1])}, [3])
>>> td.memmap_()
>>> assert isinstance(td["b", "c"], MemmapTensor)
>>>
>>> app_state = {
...     "state": torchsnapshot.StateDict(tensordict=td.state_dict(keep_vars=True))
... }
>>> snapshot = torchsnapshot.Snapshot.take(app_state=app_state, path=f"/tmp/{uuid.uuid4()}")
>>>
>>>
>>> td_dest = TensorDict({"a": torch.zeros(3), "b": TensorDict({"c": torch.zeros(3, 1)}, [3, 1])}, [3])
>>> td_dest.memmap_()
>>> assert isinstance(td_dest["b", "c"], MemmapTensor)
>>> app_state = {
...     "state": torchsnapshot.StateDict(tensordict=td_dest.state_dict(keep_vars=True))
... }
>>> snapshot.restore(app_state=app_state)
>>> # sanity check
>>> assert (td_dest == td).all()
>>> assert (td_dest["b"].batch_size == td["b"].batch_size)
>>> assert isinstance(td_dest["b", "c"], MemmapTensor)

最后,tensorclass 也支持此功能。代码与上面的非常相似:

>>> from __future__ import annotations
>>> import uuid
>>> from typing import Union, Optional
>>>
>>> import torchsnapshot
>>> from tensordict import TensorDict, MemmapTensor
>>> import torch
>>> from tensordict.prototype import tensorclass
>>>
>>> @tensorclass
>>> class MyClass:
...      x: torch.Tensor
...      y: Optional[MyClass]=None
...
>>> tc = MyClass(x=torch.randn(3), y=MyClass(x=torch.randn(3), batch_size=[]), batch_size=[])
>>> tc.memmap_()
>>> assert isinstance(tc.y.x, MemmapTensor)
>>>
>>> app_state = {
...     "state": torchsnapshot.StateDict(tensordict=tc.state_dict(keep_vars=True))
... }
>>> snapshot = torchsnapshot.Snapshot.take(app_state=app_state, path=f"/tmp/{uuid.uuid4()}")
>>>
>>> tc_dest = MyClass(x=torch.randn(3), y=MyClass(x=torch.randn(3), batch_size=[]), batch_size=[])
>>> tc_dest.memmap_()
>>> assert isinstance(tc_dest.y.x, MemmapTensor)
>>> app_state = {
...     "state": torchsnapshot.StateDict(tensordict=tc_dest.state_dict(keep_vars=True))
... }
>>> snapshot.restore(app_state=app_state)
>>>
>>> assert (tc_dest == tc).all()
>>> assert (tc_dest.y.batch_size == tc.y.batch_size)
>>> assert isinstance(tc_dest.y.x, MemmapTensor)

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