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自定义 C++ 和 CUDA 扩展#

创建时间:2018 年 4 月 26 日 | 最近更新:2025 年 3 月 19 日 | 最近验证:2024 年 11 月 5 日

作者Peter Goldsborough

警告

本教程自 PyTorch 2.4 起已弃用。请参阅PyTorch 自定义操作符,了解使用自定义 C++/CUDA 扩展 PyTorch 的最新指南。

PyTorch 提供了大量与神经网络、任意张量代数、数据整理和其他用途相关的操作。然而,您可能仍然需要更自定义的操作。例如,您可能想使用在论文中发现的新颖激活函数,或者实现您在研究中开发的操作。

在 PyTorch 中集成此类自定义操作的最简单方法是,如此处所述,通过扩展 FunctionModule 在 Python 中编写它。这为您提供了自动微分的全部功能(省去了编写导数函数),以及 Python 通常的表达能力。然而,有时您的操作可能更适合用 C++ 实现。例如,您的代码可能需要非常快,因为它在模型中被频繁调用,或者即使调用次数很少,也开销很大。另一个可能的原因是它依赖于或与其他的 C 或 C++ 库交互。为了解决这些情况,PyTorch 提供了一种非常简单的方法来编写自定义的C++ 扩展

C++ 扩展是我们开发的一种机制,允许用户(您)创建源外定义的 PyTorch 操作符,即独立于 PyTorch 后端。这种方法与原生 PyTorch 操作的实现方式不同。C++ 扩展旨在为您省去与 PyTorch 后端集成操作相关的许多样板代码,同时为您的基于 PyTorch 的项目提供高度的灵活性。尽管如此,一旦您将操作定义为 C++ 扩展,将其转换为原生 PyTorch 函数基本上只是代码组织问题,如果您决定将您的操作贡献到上游,您可以稍后再处理。

动机与示例#

本文的其余部分将通过一个实际示例来演示如何编写和使用 C++ (和 CUDA) 扩展。如果您时间紧迫,或者有人会在今天结束前解雇您,如果您的操作无法完成,您可以跳过本节,直接进入下一节的实现细节。

假设您提出了一种新型循环单元,发现它比现有技术具有优越的特性。该循环单元类似于 LSTM,但不同之处在于它缺少*遗忘门*并使用*指数线性单元*(ELU)作为其内部激活函数。由于该单元永不遗忘,我们将其命名为*LLTM*,即*长长期记忆*单元。

LLTM 与普通 LSTM 的两种不同之处足以让我们无法为我们的目的配置 PyTorch 的 LSTMCell,因此我们必须创建一个自定义单元。实现此目的的第一种也是最简单的方法——并且在所有情况下可能都是很好的第一步——是用纯 PyTorch 和 Python 实现我们所需的功能。为此,我们需要子类化 torch.nn.Module 并实现 LLTM 的前向传播。这看起来像这样

class LLTM(torch.nn.Module):
    def __init__(self, input_features, state_size):
        super(LLTM, self).__init__()
        self.input_features = input_features
        self.state_size = state_size
        # 3 * state_size for input gate, output gate and candidate cell gate.
        # input_features + state_size because we will multiply with [input, h].
        self.weights = torch.nn.Parameter(
            torch.empty(3 * state_size, input_features + state_size))
        self.bias = torch.nn.Parameter(torch.empty(3 * state_size))
        self.reset_parameters()

    def reset_parameters(self):
        stdv = 1.0 / math.sqrt(self.state_size)
        for weight in self.parameters():
            weight.data.uniform_(-stdv, +stdv)

    def forward(self, input, state):
        old_h, old_cell = state
        X = torch.cat([old_h, input], dim=1)

        # Compute the input, output and candidate cell gates with one MM.
        gate_weights = F.linear(X, self.weights, self.bias)
        # Split the combined gate weight matrix into its components.
        gates = gate_weights.chunk(3, dim=1)

        input_gate = torch.sigmoid(gates[0])
        output_gate = torch.sigmoid(gates[1])
        # Here we use an ELU instead of the usual tanh.
        candidate_cell = F.elu(gates[2])

        # Compute the new cell state.
        new_cell = old_cell + candidate_cell * input_gate
        # Compute the new hidden state and output.
        new_h = torch.tanh(new_cell) * output_gate

        return new_h, new_cell

然后我们可以按预期使用它

import torch

X = torch.randn(batch_size, input_features)
h = torch.randn(batch_size, state_size)
C = torch.randn(batch_size, state_size)

rnn = LLTM(input_features, state_size)

new_h, new_C = rnn(X, (h, C))

当然,如果可能且合理,您应该使用这种方法来扩展 PyTorch。由于 PyTorch 针对 CPU 和 GPU 都有高度优化的操作实现,并由 NVIDIA cuDNN、Intel MKL 或 NNPACK 等库提供支持,因此上述 PyTorch 代码通常足够快。然而,我们也可以看到在某些情况下,为什么还有进一步提高性能的空间。最明显的原因是 PyTorch 不了解您正在实现的算法。它只知道您用来组成算法的单个操作。因此,PyTorch 必须一个接一个地单独执行您的操作。由于对操作实现(或内核)的每次单独调用(可能涉及启动 CUDA 内核)都有一定的开销,因此这种开销在许多函数调用中可能会变得非常大。此外,运行我们代码的 Python 解释器本身也会减慢我们的程序。

因此,加速的一种明确方法是使用 C++(或 CUDA)重写部分代码并*融合*特定组操作。融合意味着将许多函数的实现组合成一个函数,这得益于更少的内核启动以及我们通过提高数据全局流程可见性可以执行的其他优化。

让我们看看如何使用 C++ 扩展来实现 LLTM 的*融合*版本。我们将首先用纯 C++ 编写它,使用驱动 PyTorch 大部分后端的 ATen 库,看看它如何轻松地将我们的 Python 代码翻译过来。然后,我们将通过将模型的部分移至 CUDA 内核来进一步加速,以受益于 GPU 提供的大规模并行性。

编写 C++ 扩展#

C++ 扩展有两种形式:它们可以使用 setuptools “提前”构建,或者通过 torch.utils.cpp_extension.load() “即时”构建。我们将从第一种方法开始,稍后讨论后一种方法。

使用 setuptools 构建#

对于“提前”构建,我们通过编写使用 setuptools 编译 C++ 代码的 setup.py 脚本来构建 C++ 扩展。对于 LLTM,它看起来就像这样简单

from setuptools import setup, Extension
from torch.utils import cpp_extension

setup(name='lltm_cpp',
      ext_modules=[cpp_extension.CppExtension('lltm_cpp', ['lltm.cpp'])],
      cmdclass={'build_ext': cpp_extension.BuildExtension})

在此代码中,CppExtensionsetuptools.Extension 的便捷包装器,它传递正确的包含路径并将扩展的语言设置为 C++。等效的普通 setuptools 代码将很简单

Extension(
   name='lltm_cpp',
   sources=['lltm.cpp'],
   include_dirs=cpp_extension.include_paths(),
   language='c++')

BuildExtension 执行一些必需的配置步骤和检查,并且还管理混合 C++/CUDA 扩展的混合编译。现在我们对构建 C++ 扩展所需了解的就这些了!现在让我们来看看 C++ 扩展的实现,它位于 lltm.cpp 中。

编写 C++ 操作#

让我们开始用 C++ 实现 LLTM!反向传播需要的一个函数是 sigmoid 的导数。这是一个足够小的代码片段,可以讨论编写 C++ 扩展时可用的整体环境

#include <torch/extension.h>

#include <iostream>

torch::Tensor d_sigmoid(torch::Tensor z) {
  auto s = torch::sigmoid(z);
  return (1 - s) * s;
}

<torch/extension.h> 是包含编写 C++ 扩展所需的所有 PyTorch 位的全能头文件。它包括

  • ATen 库,它是我们进行张量计算的主要 API,

  • pybind11,我们用它为 C++ 代码创建 Python 绑定,

  • 管理 ATen 和 pybind11 之间交互细节的头文件。

d_sigmoid() 的实现展示了如何使用 ATen API。PyTorch 的张量和变量接口是从 ATen 库自动生成的,因此我们可以或多或少地将我们的 Python 实现 1:1 翻译成 C++。我们所有计算的主要数据类型都将是 torch::Tensor。它的完整 API 可以在此处查看。另请注意,我们可以包含 <iostream> 或*任何其他 C 或 C++ 头文件*——我们拥有 C++11 的全部功能。

请注意,CUDA-11.5 nvcc 在 Windows 上解析 torch/extension.h 时会遇到内部编译器错误。要解决此问题,请将 Python 绑定逻辑移动到纯 C++ 文件中。使用示例:

#include <ATen/ATen.h>
at::Tensor SigmoidAlphaBlendForwardCuda(....)

而不是

#include <torch/extension.h>
torch::Tensor SigmoidAlphaBlendForwardCuda(...)

当前 nvcc 错误问题:此处。完整的解决方法代码示例:此处

前向传播#

接下来我们可以将整个前向传播移植到 C++

#include <vector>

std::vector<at::Tensor> lltm_forward(
    torch::Tensor input,
    torch::Tensor weights,
    torch::Tensor bias,
    torch::Tensor old_h,
    torch::Tensor old_cell) {
  auto X = torch::cat({old_h, input}, /*dim=*/1);

  auto gate_weights = torch::addmm(bias, X, weights.transpose(0, 1));
  auto gates = gate_weights.chunk(3, /*dim=*/1);

  auto input_gate = torch::sigmoid(gates[0]);
  auto output_gate = torch::sigmoid(gates[1]);
  auto candidate_cell = torch::elu(gates[2], /*alpha=*/1.0);

  auto new_cell = old_cell + candidate_cell * input_gate;
  auto new_h = torch::tanh(new_cell) * output_gate;

  return {new_h,
          new_cell,
          input_gate,
          output_gate,
          candidate_cell,
          X,
          gate_weights};
}

反向传播#

C++ 扩展 API 目前没有提供为我们自动生成反向函数的方法。因此,我们还必须实现 LLTM 的反向传播,它计算损失相对于前向传播每个输入的导数。最终,我们会将前向和反向函数都放入 torch.autograd.Function 中,以创建一个漂亮的 Python 绑定。反向函数稍微复杂一些,因此我们不会深入探讨代码(如果您有兴趣,Alex Graves 的论文是一个很好的读物,可以了解更多信息)

// tanh'(z) = 1 - tanh^2(z)
torch::Tensor d_tanh(torch::Tensor z) {
  return 1 - z.tanh().pow(2);
}

// elu'(z) = relu'(z) + { alpha * exp(z) if (alpha * (exp(z) - 1)) < 0, else 0}
torch::Tensor d_elu(torch::Tensor z, torch::Scalar alpha = 1.0) {
  auto e = z.exp();
  auto mask = (alpha * (e - 1)) < 0;
  return (z > 0).type_as(z) + mask.type_as(z) * (alpha * e);
}

std::vector<torch::Tensor> lltm_backward(
    torch::Tensor grad_h,
    torch::Tensor grad_cell,
    torch::Tensor new_cell,
    torch::Tensor input_gate,
    torch::Tensor output_gate,
    torch::Tensor candidate_cell,
    torch::Tensor X,
    torch::Tensor gate_weights,
    torch::Tensor weights) {
  auto d_output_gate = torch::tanh(new_cell) * grad_h;
  auto d_tanh_new_cell = output_gate * grad_h;
  auto d_new_cell = d_tanh(new_cell) * d_tanh_new_cell + grad_cell;

  auto d_old_cell = d_new_cell;
  auto d_candidate_cell = input_gate * d_new_cell;
  auto d_input_gate = candidate_cell * d_new_cell;

  auto gates = gate_weights.chunk(3, /*dim=*/1);
  d_input_gate *= d_sigmoid(gates[0]);
  d_output_gate *= d_sigmoid(gates[1]);
  d_candidate_cell *= d_elu(gates[2]);

  auto d_gates =
      torch::cat({d_input_gate, d_output_gate, d_candidate_cell}, /*dim=*/1);

  auto d_weights = d_gates.t().mm(X);
  auto d_bias = d_gates.sum(/*dim=*/0, /*keepdim=*/true);

  auto d_X = d_gates.mm(weights);
  const auto state_size = grad_h.size(1);
  auto d_old_h = d_X.slice(/*dim=*/1, 0, state_size);
  auto d_input = d_X.slice(/*dim=*/1, state_size);

  return {d_old_h, d_input, d_weights, d_bias, d_old_cell};
}

绑定到 Python#

一旦您用 C++ 和 ATen 编写了操作,您就可以使用 pybind11 以非常简单的方式将您的 C++ 函数或类绑定到 Python 中。您对 PyTorch C++ 扩展的这部分问题或疑虑,大部分都会在 pybind11 文档中得到解答。

对于我们的扩展,所需的绑定代码仅跨越四行

PYBIND11_MODULE(TORCH_EXTENSION_NAME, m) {
  m.def("forward", &lltm_forward, "LLTM forward");
  m.def("backward", &lltm_backward, "LLTM backward");
}

这里需要注意的是宏 TORCH_EXTENSION_NAME。torch 扩展构建会将其定义为您在 setup.py 脚本中为扩展指定的名称。在这种情况下,TORCH_EXTENSION_NAME 的值将是“lltm_cpp”。这是为了避免在两个地方(构建脚本和您的 C++ 代码)维护扩展名称,因为两者之间的不匹配可能导致讨厌且难以追踪的问题。

使用您的扩展#

我们现在可以在 PyTorch 中导入我们的扩展了。此时,您的目录结构可能如下所示

pytorch/
  lltm-extension/
    lltm.cpp
    setup.py

现在,运行 python setup.py install 来构建和安装您的扩展。这应该看起来像这样

running install
running bdist_egg
running egg_info
creating lltm_cpp.egg-info
writing lltm_cpp.egg-info/PKG-INFO
writing dependency_links to lltm_cpp.egg-info/dependency_links.txt
writing top-level names to lltm_cpp.egg-info/top_level.txt
writing manifest file 'lltm_cpp.egg-info/SOURCES.txt'
reading manifest file 'lltm_cpp.egg-info/SOURCES.txt'
writing manifest file 'lltm_cpp.egg-info/SOURCES.txt'
installing library code to build/bdist.linux-x86_64/egg
running install_lib
running build_ext
building 'lltm_cpp' extension
creating build
creating build/temp.linux-x86_64-3.7
gcc -pthread -B ~/local/miniconda/compiler_compat -Wl,--sysroot=/ -Wsign-compare -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC -I~/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/torch/include -I~/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/torch/include/torch/csrc/api/include -I~/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/torch/include/TH -I~/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/torch/include/THC -I~/local/miniconda/include/python3.7m -c lltm.cpp -o build/temp.linux-x86_64-3.7/lltm.o -DTORCH_API_INCLUDE_EXTENSION_H -DTORCH_EXTENSION_NAME=lltm_cpp -D_GLIBCXX_USE_CXX11_ABI=1 -std=c++11
cc1plus: warning: command line option ‘-Wstrict-prototypes’ is valid for C/ObjC but not for C++
creating build/lib.linux-x86_64-3.7
g++ -pthread -shared -B ~/local/miniconda/compiler_compat -L~/local/miniconda/lib -Wl,-rpath=~/local/miniconda/lib -Wl,--no-as-needed -Wl,--sysroot=/ build/temp.linux-x86_64-3.7/lltm.o -o build/lib.linux-x86_64-3.7/lltm_cpp.cpython-37m-x86_64-linux-gnu.so
creating build/bdist.linux-x86_64
creating build/bdist.linux-x86_64/egg
copying build/lib.linux-x86_64-3.7/lltm_cpp.cpython-37m-x86_64-linux-gnu.so -> build/bdist.linux-x86_64/egg
creating stub loader for lltm_cpp.cpython-37m-x86_64-linux-gnu.so
byte-compiling build/bdist.linux-x86_64/egg/lltm_cpp.py to lltm_cpp.cpython-37.pyc
creating build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO
copying lltm_cpp.egg-info/PKG-INFO -> build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO
copying lltm_cpp.egg-info/SOURCES.txt -> build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO
copying lltm_cpp.egg-info/dependency_links.txt -> build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO
copying lltm_cpp.egg-info/top_level.txt -> build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO
writing build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO/native_libs.txt
zip_safe flag not set; analyzing archive contents...
__pycache__.lltm_cpp.cpython-37: module references __file__
creating 'dist/lltm_cpp-0.0.0-py3.7-linux-x86_64.egg' and adding 'build/bdist.linux-x86_64/egg' to it
removing 'build/bdist.linux-x86_64/egg' (and everything under it)
Processing lltm_cpp-0.0.0-py3.7-linux-x86_64.egg
removing '~/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/lltm_cpp-0.0.0-py3.7-linux-x86_64.egg' (and everything under it)
creating ~/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/lltm_cpp-0.0.0-py3.7-linux-x86_64.egg
Extracting lltm_cpp-0.0.0-py3.7-linux-x86_64.egg to ~/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages
lltm-cpp 0.0.0 is already the active version in easy-install.pth

Installed ~/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/lltm_cpp-0.0.0-py3.7-linux-x86_64.egg
Processing dependencies for lltm-cpp==0.0.0
Finished processing dependencies for lltm-cpp==0.0.0

关于编译器的简短说明:由于 ABI 版本问题,您用于构建 C++ 扩展的编译器必须与构建 PyTorch 的编译器 ABI 兼容。实际上,这意味着在 Linux 上您必须使用 GCC 4.9 及以上版本。对于 Ubuntu 16.04 和其他较新的 Linux 发行版,这应该已经是默认编译器。在 MacOS 上,您必须使用 clang(它没有任何 ABI 版本问题)。最糟糕的情况是,您可以使用您的编译器从源代码构建 PyTorch,然后使用相同的编译器构建扩展。

一旦您的扩展构建完成,您只需使用在 setup.py 脚本中指定的名称将其导入 Python。请务必先 import torch,因为这将解析动态链接器必须看到的一些符号

In [1]: import torch
In [2]: import lltm_cpp
In [3]: lltm_cpp.forward
Out[3]: <function lltm.PyCapsule.forward>

如果我们对函数或模块调用 help(),我们可以看到它的签名与我们的 C++ 代码匹配

In[4] help(lltm_cpp.forward)
forward(...) method of builtins.PyCapsule instance
    forward(arg0: torch::Tensor, arg1: torch::Tensor, arg2: torch::Tensor, arg3: torch::Tensor, arg4: torch::Tensor) -> List[torch::Tensor]

    LLTM forward

由于我们现在能够从 Python 调用我们的 C++ 函数,我们可以用 torch.autograd.Functiontorch.nn.Module 包装它们,使它们成为 PyTorch 的一等公民

import math
import torch

# Our module!
import lltm_cpp

class LLTMFunction(torch.autograd.Function):
    @staticmethod
    def forward(ctx, input, weights, bias, old_h, old_cell):
        outputs = lltm_cpp.forward(input, weights, bias, old_h, old_cell)
        new_h, new_cell = outputs[:2]
        variables = outputs[1:] + [weights]
        ctx.save_for_backward(*variables)

        return new_h, new_cell

    @staticmethod
    def backward(ctx, grad_h, grad_cell):
        outputs = lltm_cpp.backward(
            grad_h.contiguous(), grad_cell.contiguous(), *ctx.saved_tensors)
        d_old_h, d_input, d_weights, d_bias, d_old_cell = outputs
        return d_input, d_weights, d_bias, d_old_h, d_old_cell


class LLTM(torch.nn.Module):
    def __init__(self, input_features, state_size):
        super(LLTM, self).__init__()
        self.input_features = input_features
        self.state_size = state_size
        self.weights = torch.nn.Parameter(
            torch.empty(3 * state_size, input_features + state_size))
        self.bias = torch.nn.Parameter(torch.empty(3 * state_size))
        self.reset_parameters()

    def reset_parameters(self):
        stdv = 1.0 / math.sqrt(self.state_size)
        for weight in self.parameters():
            weight.data.uniform_(-stdv, +stdv)

    def forward(self, input, state):
        return LLTMFunction.apply(input, self.weights, self.bias, *state)

性能比较#

现在我们能够在 PyTorch 中使用和调用我们的 C++ 代码,我们可以运行一个小基准测试,看看将操作重写为 C++ 带来了多少性能提升。我们将 LLTM 前向和反向运行几次并测量持续时间

import time

import torch

batch_size = 16
input_features = 32
state_size = 128

X = torch.randn(batch_size, input_features)
h = torch.randn(batch_size, state_size)
C = torch.randn(batch_size, state_size)

rnn = LLTM(input_features, state_size)

forward = 0
backward = 0
for _ in range(100000):
    start = time.time()
    new_h, new_C = rnn(X, (h, C))
    forward += time.time() - start

    start = time.time()
    (new_h.sum() + new_C.sum()).backward()
    backward += time.time() - start

print('Forward: {:.3f} s | Backward {:.3f} s'.format(forward, backward))

如果使用本文开头用纯 Python 编写的原始 LLTM 运行此代码,我得到的数字(在我的机器上)如下

Forward: 506.480 us | Backward 444.694 us

使用新的 C++ 版本

Forward: 349.335 us | Backward 443.523 us

我们已经可以看到前向函数显着加速(超过 30%)。对于反向函数,加速是可见的,尽管不是主要的。我上面编写的反向传播并没有特别优化,肯定可以改进。此外,PyTorch 的自动微分引擎可以自动并行化计算图,可能整体使用更高效的操作流,并且也用 C++ 实现,因此预计会很快。尽管如此,这是一个很好的开始。

GPU 设备上的性能#

PyTorch 的 *ATen* 后端的一个绝妙之处在于它抽象了您正在运行的计算设备。这意味着我们为 CPU 编写的相同代码*也*可以在 GPU 上运行,并且各个操作将相应地调度到 GPU 优化的实现。对于某些操作,例如矩阵乘法(如 mmaddmm),这是一个巨大的胜利。让我们看看通过使用 CUDA 张量运行 C++ 代码可以获得多少性能提升。我们的实现不需要任何更改,我们只需通过在创建时添加 device=cuda_device 参数或在创建后使用 .to(cuda_device) 将张量放入 GPU 内存中

import torch

assert torch.cuda.is_available()
cuda_device = torch.device("cuda")  # device object representing GPU

batch_size = 16
input_features = 32
state_size = 128

# Note the device=cuda_device arguments here
X = torch.randn(batch_size, input_features, device=cuda_device)
h = torch.randn(batch_size, state_size, device=cuda_device)
C = torch.randn(batch_size, state_size, device=cuda_device)

rnn = LLTM(input_features, state_size).to(cuda_device)

forward = 0
backward = 0
for _ in range(100000):
    start = time.time()
    new_h, new_C = rnn(X, (h, C))
    torch.cuda.synchronize()
    forward += time.time() - start

    start = time.time()
    (new_h.sum() + new_C.sum()).backward()
    torch.cuda.synchronize()
    backward += time.time() - start

print('Forward: {:.3f} us | Backward {:.3f} us'.format(forward * 1e6/1e5, backward * 1e6/1e5))

将我们的纯 PyTorch 代码与我们的 C++ 版本再次进行比较,现在都在 CUDA 设备上运行,我们再次看到了性能提升。对于 Python/PyTorch

Forward: 187.719 us | Backward 410.815 us

以及 C++/ATen

Forward: 149.802 us | Backward 393.458 us

与非 CUDA 代码相比,这是一个巨大的整体加速。然而,通过编写自定义 CUDA 内核,我们可以从 C++ 代码中获得更多性能,我们很快就会深入探讨这一点。在此之前,让我们讨论另一种构建 C++ 扩展的方式。

JIT 编译扩展#

之前,我提到有两种构建 C++ 扩展的方法:使用 setuptools 或即时 (JIT)。涵盖了前者之后,我们来详细说明后者。JIT 编译机制提供了一种通过调用 PyTorch API 中一个名为 torch.utils.cpp_extension.load() 的简单函数来即时编译和加载您的扩展的方法。对于 LLTM,这看起来很简单

from torch.utils.cpp_extension import load

lltm_cpp = load(name="lltm_cpp", sources=["lltm.cpp"])

这里,我们为函数提供与 setuptools 相同的信息。在后台,它将执行以下操作

  1. 创建一个临时目录 /tmp/torch_extensions/lltm

  2. Ninja 构建文件输出到该临时目录中,

  3. 将您的源文件编译成共享库,

  4. 将此共享库作为 Python 模块导入。

事实上,如果您将 verbose=True 传递给 cpp_extension.load(),您将获得有关该过程的信息

Using /tmp/torch_extensions as PyTorch extensions root...
Emitting ninja build file /tmp/torch_extensions/lltm_cpp/build.ninja...
Building extension module lltm_cpp...
Loading extension module lltm_cpp...

生成的 Python 模块将与 setuptools 生成的完全相同,但消除了维护单独的 setup.py 构建文件的要求。如果您的设置更复杂并且确实需要 setuptools 的全部功能,您*可以*编写自己的 setup.py ——但在许多情况下,这种 JIT 技术就足够了。您第一次运行此行时,会花费一些时间,因为扩展正在后台编译。由于我们使用 Ninja 构建系统来构建您的源代码,因此重新编译是增量的,因此当您第二次运行 Python 模块时,如果您没有更改扩展的源文件,重新加载扩展会很快且开销很小。

编写混合 C++/CUDA 扩展#

为了真正将我们的实现提升到一个新的水平,我们可以使用自定义 CUDA 内核手动编写我们前向和反向传播的一部分。对于 LLTM,这可能会特别有效,因为序列中存在大量的逐点操作,所有这些操作都可以在单个 CUDA 内核中融合和并行化。让我们看看如何编写这样的 CUDA 内核并使用此扩展机制将其与 PyTorch 集成。

编写 CUDA 扩展的一般策略是:首先编写一个 C++ 文件,该文件定义将从 Python 调用函数,并使用 pybind11 将这些函数绑定到 Python。此外,该文件还将*声明*在 CUDA (.cu) 文件中定义的函数。然后,C++ 函数将进行一些检查,并最终将其调用转发到 CUDA 函数。在 CUDA 文件中,我们编写实际的 CUDA 内核。cpp_extension 包将负责使用 C++ 编译器(如 gcc)编译 C++ 源文件,并使用 NVIDIA 的 nvcc 编译器编译 CUDA 源文件。这确保每个编译器都处理它最擅长编译的文件。最终,它们将链接到一个共享库中,该共享库可供我们从 Python 代码中使用。

我们将从 C++ 文件开始,例如,我们将其命名为 lltm_cuda.cpp

#include <torch/extension.h>

#include <vector>

// CUDA forward declarations

std::vector<torch::Tensor> lltm_cuda_forward(
    torch::Tensor input,
    torch::Tensor weights,
    torch::Tensor bias,
    torch::Tensor old_h,
    torch::Tensor old_cell);

std::vector<torch::Tensor> lltm_cuda_backward(
    torch::Tensor grad_h,
    torch::Tensor grad_cell,
    torch::Tensor new_cell,
    torch::Tensor input_gate,
    torch::Tensor output_gate,
    torch::Tensor candidate_cell,
    torch::Tensor X,
    torch::Tensor gate_weights,
    torch::Tensor weights);

// C++ interface

#define CHECK_CUDA(x) TORCH_CHECK(x.device().is_cuda(), #x " must be a CUDA tensor")
#define CHECK_CONTIGUOUS(x) TORCH_CHECK(x.is_contiguous(), #x " must be contiguous")
#define CHECK_INPUT(x) CHECK_CUDA(x); CHECK_CONTIGUOUS(x)

std::vector<torch::Tensor> lltm_forward(
    torch::Tensor input,
    torch::Tensor weights,
    torch::Tensor bias,
    torch::Tensor old_h,
    torch::Tensor old_cell) {
  CHECK_INPUT(input);
  CHECK_INPUT(weights);
  CHECK_INPUT(bias);
  CHECK_INPUT(old_h);
  CHECK_INPUT(old_cell);

  return lltm_cuda_forward(input, weights, bias, old_h, old_cell);
}

std::vector<torch::Tensor> lltm_backward(
    torch::Tensor grad_h,
    torch::Tensor grad_cell,
    torch::Tensor new_cell,
    torch::Tensor input_gate,
    torch::Tensor output_gate,
    torch::Tensor candidate_cell,
    torch::Tensor X,
    torch::Tensor gate_weights,
    torch::Tensor weights) {
  CHECK_INPUT(grad_h);
  CHECK_INPUT(grad_cell);
  CHECK_INPUT(input_gate);
  CHECK_INPUT(output_gate);
  CHECK_INPUT(candidate_cell);
  CHECK_INPUT(X);
  CHECK_INPUT(gate_weights);
  CHECK_INPUT(weights);

  return lltm_cuda_backward(
      grad_h,
      grad_cell,
      new_cell,
      input_gate,
      output_gate,
      candidate_cell,
      X,
      gate_weights,
      weights);
}

PYBIND11_MODULE(TORCH_EXTENSION_NAME, m) {
  m.def("forward", &lltm_forward, "LLTM forward (CUDA)");
  m.def("backward", &lltm_backward, "LLTM backward (CUDA)");
}

如您所见,它主要是样板代码、检查和转发到我们将在 CUDA 文件中定义的函数。我们将此文件命名为 lltm_cuda_kernel.cu(请注意 .cu 扩展名!)。NVCC 可以合理地编译 C++11,因此我们仍然可以使用 ATen 和 C++ 标准库(但不能使用 torch.h)。请注意,setuptools 无法处理同名但不同扩展名的文件,因此如果您使用 setup.py 方法而不是 JIT 方法,您必须为 CUDA 文件指定与 C++ 文件不同的名称(对于 JIT 方法,lltm.cpplltm.cu 都可以正常工作)。让我们简单地看一下这个文件会是什么样子

#include <torch/extension.h>

#include <cuda.h>
#include <cuda_runtime.h>

#include <vector>

template <typename scalar_t>
__device__ __forceinline__ scalar_t sigmoid(scalar_t z) {
  return 1.0 / (1.0 + exp(-z));
}

在这里我们看到了我刚刚描述的头文件,以及我们正在使用 CUDA 特定的声明,例如 __device____forceinline__ 以及函数,例如 exp。让我们继续讨论一些我们需要的更多辅助函数

template <typename scalar_t>
__device__ __forceinline__ scalar_t d_sigmoid(scalar_t z) {
  const auto s = sigmoid(z);
  return (1.0 - s) * s;
}

template <typename scalar_t>
__device__ __forceinline__ scalar_t d_tanh(scalar_t z) {
  const auto t = tanh(z);
  return 1 - (t * t);
}

template <typename scalar_t>
__device__ __forceinline__ scalar_t elu(scalar_t z, scalar_t alpha = 1.0) {
  return fmax(0.0, z) + fmin(0.0, alpha * (exp(z) - 1.0));
}

template <typename scalar_t>
__device__ __forceinline__ scalar_t d_elu(scalar_t z, scalar_t alpha = 1.0) {
  const auto e = exp(z);
  const auto d_relu = z < 0.0 ? 0.0 : 1.0;
  return d_relu + (((alpha * (e - 1.0)) < 0.0) ? (alpha * e) : 0.0);
}

现在要实际实现一个函数,我们仍然需要两件事:一个执行我们不希望手动明确编写的操作并调用 CUDA 内核的函数,以及用于我们想要加速的部分的实际 CUDA 内核。对于前向传播,第一个函数应该看起来像这样

std::vector<torch::Tensor> lltm_cuda_forward(
    torch::Tensor input,
    torch::Tensor weights,
    torch::Tensor bias,
    torch::Tensor old_h,
    torch::Tensor old_cell) {
  auto X = torch::cat({old_h, input}, /*dim=*/1);
  auto gates = torch::addmm(bias, X, weights.transpose(0, 1));

  const auto batch_size = old_cell.size(0);
  const auto state_size = old_cell.size(1);

  auto new_h = torch::zeros_like(old_cell);
  auto new_cell = torch::zeros_like(old_cell);
  auto input_gate = torch::zeros_like(old_cell);
  auto output_gate = torch::zeros_like(old_cell);
  auto candidate_cell = torch::zeros_like(old_cell);

  const int threads = 1024;
  const dim3 blocks((state_size + threads - 1) / threads, batch_size);

  AT_DISPATCH_FLOATING_TYPES(gates.type(), "lltm_forward_cuda", ([&] {
    lltm_cuda_forward_kernel<scalar_t><<<blocks, threads>>>(
        gates.data<scalar_t>(),
        old_cell.data<scalar_t>(),
        new_h.data<scalar_t>(),
        new_cell.data<scalar_t>(),
        input_gate.data<scalar_t>(),
        output_gate.data<scalar_t>(),
        candidate_cell.data<scalar_t>(),
        state_size);
  }));

  return {new_h, new_cell, input_gate, output_gate, candidate_cell, X, gates};
}

这里最主要的一点是 AT_DISPATCH_FLOATING_TYPES 宏和内核启动(由 <<<...>>> 表示)。虽然 ATen 抽象了我们处理的张量的设备和数据类型,但张量在运行时仍然由具体类型在具体设备上的内存支持。因此,我们需要一种方法在运行时确定张量的类型,然后选择性地调用具有相应正确类型签名的函数。手动完成,这(概念上)看起来像这样

switch (tensor.type().scalarType()) {
  case torch::ScalarType::Double:
    return function<double>(tensor.data<double>());
  case torch::ScalarType::Float:
    return function<float>(tensor.data<float>());
  ...
}

AT_DISPATCH_FLOATING_TYPES 的目的是为我们处理这种调度。它接受一个类型(在我们的例子中是 gates.type())、一个名称(用于错误消息)和一个 lambda 函数。在这个 lambda 函数内部,类型别名 scalar_t 可用,并被定义为该上下文中张量在运行时实际的类型。因此,如果我们有一个模板函数(我们的 CUDA 内核将是),我们可以使用此 scalar_t 别名实例化它,并且将调用正确的函数。在这种情况下,我们还希望将张量的数据指针作为该 scalar_t 类型指针检索。如果您想调度所有类型而不仅仅是浮点类型(FloatDouble),您可以使用 AT_DISPATCH_ALL_TYPES

请注意,我们使用普通的 ATen 执行某些操作。这些操作仍将在 GPU 上运行,但使用 ATen 的默认实现。这很合理,因为 ATen 会对矩阵乘法(例如 addmm)或卷积等操作使用高度优化的例程,这些例程我们自己实现和改进会困难得多。

至于内核启动本身,我们在这里指定每个 CUDA 块将有 1024 个线程,并且整个 GPU 网格被分成尽可能多的 1 x 1024 线程块,以使我们的矩阵中每个组件都有一个线程。例如,如果我们的状态大小为 2048 且批处理大小为 4,我们将总共启动 4 x 2 = 8 个块,每个块有 1024 个线程。如果您以前从未听说过 CUDA “块”或“网格”,关于 CUDA 的入门读物可能会有所帮助。

实际的 CUDA 内核相当简单(如果您曾经编程过 GPU)

template <typename scalar_t>
__global__ void lltm_cuda_forward_kernel(
    const scalar_t* __restrict__ gates,
    const scalar_t* __restrict__ old_cell,
    scalar_t* __restrict__ new_h,
    scalar_t* __restrict__ new_cell,
    scalar_t* __restrict__ input_gate,
    scalar_t* __restrict__ output_gate,
    scalar_t* __restrict__ candidate_cell,
    size_t state_size) {
  const int column = blockIdx.x * blockDim.x + threadIdx.x;
  const int index = blockIdx.y * state_size + column;
  const int gates_row = blockIdx.y * (state_size * 3);
  if (column < state_size) {
    input_gate[index] = sigmoid(gates[gates_row + column]);
    output_gate[index] = sigmoid(gates[gates_row + state_size + column]);
    candidate_cell[index] = elu(gates[gates_row + 2 * state_size + column]);
    new_cell[index] =
        old_cell[index] + candidate_cell[index] * input_gate[index];
    new_h[index] = tanh(new_cell[index]) * output_gate[index];
  }
}

这里最主要有趣的是,我们能够并行地计算所有这些逐点操作,对于我们的门矩阵中的每个单独组件都是如此。如果您想象必须在一个包含一百万个元素的巨型 for 循环中串行执行此操作,您就会明白为什么这会快得多。

使用访问器#

在 CUDA 内核中,您可以看到我们直接使用正确类型的指针。确实,在 CUDA 内核中直接使用高级类型无关张量效率会非常低。

然而,这牺牲了易用性和可读性,特别是对于高维数据。在我们的例子中,我们知道例如连续的 gates 张量有 3 个维度

  1. 批次,大小为 batch_size,步长为 3*state_size

  2. 行,大小为 3,步长为 state_size

  3. 索引,大小为 state_size,步长为 1

那么,如何在内核内部访问元素 gates[n][row][column] 呢?结果是,您需要步长来通过一些简单的算术访问您的元素。

gates.data<scalar_t>()[n*3*state_size + row*state_size + column]

除了冗长之外,此表达式需要明确知道步长,因此需要在其参数中将其传递给内核函数。您可以看到,在内核函数接受具有不同大小的多个张量的情况下,您将得到一个非常长的参数列表。

幸运的是,ATen 提供了访问器,这些访问器通过单个动态检查来创建,以确定张量的类型和维度数。然后,访问器公开了一个 API,用于高效访问张量元素,而无需转换为单个指针

torch::Tensor foo = torch::rand({12, 12});

// assert foo is 2-dimensional and holds floats.
auto foo_a = foo.accessor<float,2>();
float trace = 0;

for(int i = 0; i < foo_a.size(0); i++) {
  // use the accessor foo_a to get tensor data.
  trace += foo_a[i][i];
}

访问器对象具有相对高级的接口,包含 .size().stride() 方法以及多维索引。.accessor<> 接口旨在高效访问 CPU 张量上的数据。CUDA 张量的等效项是 packed_accessor64<>packed_accessor32<>,它们生成具有 64 位或 32 位整数索引的 Packed Accessor。

与访问器最根本的区别在于,Packed Accessor 在其结构内部复制大小和步长数据,而不是指向它。它允许我们将其传递给 CUDA 内核函数并在其中使用其接口。

我们可以设计一个接受 Packed Accessor 而不是指针的函数。

__global__ void lltm_cuda_forward_kernel(
    const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,3,torch::RestrictPtrTraits> gates,
    const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> old_cell,
    torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> new_h,
    torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> new_cell,
    torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> input_gate,
    torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> output_gate,
    torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> candidate_cell)

让我们分解这里使用的模板。前两个参数 scalar_t2 与常规 Accessor 相同。参数 torch::RestrictPtrTraits 表示必须使用 __restrict__ 关键字。另请注意,我们使用了 PackedAccessor32 变体,它将大小和步幅存储在 int32_t 中。这很重要,因为使用 64 位变体 (PackedAccessor64) 会使内核变慢。

函数声明变为

template <typename scalar_t>
__global__ void lltm_cuda_forward_kernel(
    const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,3,torch::RestrictPtrTraits> gates,
    const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> old_cell,
    torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> new_h,
    torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> new_cell,
    torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> input_gate,
    torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> output_gate,
    torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> candidate_cell) {
  //batch index
  const int n = blockIdx.y;
  // column index
  const int c = blockIdx.x * blockDim.x + threadIdx.x;
  if (c < gates.size(2)){
    input_gate[n][c] = sigmoid(gates[n][0][c]);
    output_gate[n][c] = sigmoid(gates[n][1][c]);
    candidate_cell[n][c] = elu(gates[n][2][c]);
    new_cell[n][c] =
        old_cell[n][c] + candidate_cell[n][c] * input_gate[n][c];
    new_h[n][c] = tanh(new_cell[n][c]) * output_gate[n][c];
  }
}

实现更具可读性!然后,通过在宿主函数中使用 .packed_accessor32<> 方法创建 Packed Accessor 来调用此函数。

std::vector<torch::Tensor> lltm_cuda_forward(
    torch::Tensor input,
    torch::Tensor weights,
    torch::Tensor bias,
    torch::Tensor old_h,
    torch::Tensor old_cell) {
  auto X = torch::cat({old_h, input}, /*dim=*/1);
  auto gate_weights = torch::addmm(bias, X, weights.transpose(0, 1));

  const auto batch_size = old_cell.size(0);
  const auto state_size = old_cell.size(1);

  auto gates = gate_weights.reshape({batch_size, 3, state_size});
  auto new_h = torch::zeros_like(old_cell);
  auto new_cell = torch::zeros_like(old_cell);
  auto input_gate = torch::zeros_like(old_cell);
  auto output_gate = torch::zeros_like(old_cell);
  auto candidate_cell = torch::zeros_like(old_cell);

  const int threads = 1024;
  const dim3 blocks((state_size + threads - 1) / threads, batch_size);

  AT_DISPATCH_FLOATING_TYPES(gates.type(), "lltm_forward_cuda", ([&] {
    lltm_cuda_forward_kernel<scalar_t><<<blocks, threads>>>(
        gates.packed_accessor32<scalar_t,3,torch::RestrictPtrTraits>(),
        old_cell.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
        new_h.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
        new_cell.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
        input_gate.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
        output_gate.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
        candidate_cell.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>());
  }));

  return {new_h, new_cell, input_gate, output_gate, candidate_cell, X, gates};
}

反向传播遵循的模式大致相同,我将不再赘述

template <typename scalar_t>
__global__ void lltm_cuda_backward_kernel(
    torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> d_old_cell,
    torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,3,torch::RestrictPtrTraits> d_gates,
    const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> grad_h,
    const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> grad_cell,
    const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> new_cell,
    const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> input_gate,
    const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> output_gate,
    const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> candidate_cell,
    const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,3,torch::RestrictPtrTraits> gate_weights) {
  //batch index
  const int n = blockIdx.y;
  // column index
  const int c = blockIdx.x * blockDim.x + threadIdx.x;
  if (c < d_gates.size(2)){
    const auto d_output_gate = tanh(new_cell[n][c]) * grad_h[n][c];
    const auto d_tanh_new_cell = output_gate[n][c] * grad_h[n][c];
    const auto d_new_cell =
        d_tanh(new_cell[n][c]) * d_tanh_new_cell + grad_cell[n][c];


    d_old_cell[n][c] = d_new_cell;
    const auto d_candidate_cell = input_gate[n][c] * d_new_cell;
    const auto d_input_gate = candidate_cell[n][c] * d_new_cell;

    d_gates[n][0][c] =
        d_input_gate * d_sigmoid(gate_weights[n][0][c]);
    d_gates[n][1][c] =
        d_output_gate * d_sigmoid(gate_weights[n][1][c]);
    d_gates[n][2][c] =
        d_candidate_cell * d_elu(gate_weights[n][2][c]);
  }
}

std::vector<torch::Tensor> lltm_cuda_backward(
    torch::Tensor grad_h,
    torch::Tensor grad_cell,
    torch::Tensor new_cell,
    torch::Tensor input_gate,
    torch::Tensor output_gate,
    torch::Tensor candidate_cell,
    torch::Tensor X,
    torch::Tensor gates,
    torch::Tensor weights) {
  auto d_old_cell = torch::zeros_like(new_cell);
  auto d_gates = torch::zeros_like(gates);

  const auto batch_size = new_cell.size(0);
  const auto state_size = new_cell.size(1);

  const int threads = 1024;
  const dim3 blocks((state_size + threads - 1) / threads, batch_size);

  AT_DISPATCH_FLOATING_TYPES(X.type(), "lltm_backward_cuda", ([&] {
    lltm_cuda_backward_kernel<scalar_t><<<blocks, threads>>>(
        d_old_cell.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
        d_gates.packed_accessor32<scalar_t,3,torch::RestrictPtrTraits>(),
        grad_h.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
        grad_cell.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
        new_cell.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
        input_gate.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
        output_gate.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
        candidate_cell.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
        gates.packed_accessor32<scalar_t,3,torch::RestrictPtrTraits>());
  }));

  auto d_gate_weights = d_gates.reshape({batch_size, 3*state_size});
  auto d_weights = d_gate_weights.t().mm(X);
  auto d_bias = d_gate_weights.sum(/*dim=*/0, /*keepdim=*/true);

  auto d_X = d_gate_weights.mm(weights);
  auto d_old_h = d_X.slice(/*dim=*/1, 0, state_size);
  auto d_input = d_X.slice(/*dim=*/1, state_size);

  return {d_old_h, d_input, d_weights, d_bias, d_old_cell, d_gates};
}

将 C++/CUDA 操作与 PyTorch 集成#

将我们支持 CUDA 的操作与 PyTorch 集成再次变得非常简单。如果您想编写一个 setup.py 脚本,它可能看起来像这样

from setuptools import setup
from torch.utils.cpp_extension import BuildExtension, CUDAExtension

setup(
    name='lltm',
    ext_modules=[
        CUDAExtension('lltm_cuda', [
            'lltm_cuda.cpp',
            'lltm_cuda_kernel.cu',
        ])
    ],
    cmdclass={
        'build_ext': BuildExtension
    })

现在我们使用 CUDAExtension() 而不是 CppExtension()。我们可以将 .cu 文件与 .cpp 文件一起指定——库会为您处理所有相关麻烦。JIT 机制甚至更简单

from torch.utils.cpp_extension import load

lltm = load(name='lltm', sources=['lltm_cuda.cpp', 'lltm_cuda_kernel.cu'])

性能比较#

我们希望通过 CUDA 对代码的点对点操作进行并行化和融合,从而提高 LLTM 的性能。让我们看看这是否成立。我们可以运行前面列出的代码来运行基准测试。我们之前最快的版本是基于 CUDA 的 C++ 代码

Forward: 149.802 us | Backward 393.458 us

现在,使用我们的自定义 CUDA 内核

Forward: 129.431 us | Backward 304.641 us

性能再次提升!

结论#

您现在应该对 PyTorch 的 C++ 扩展机制以及使用它们的动机有了很好的了解。您可以在此处找到本说明中展示的代码示例。如果您有任何问题,请使用论坛。如果您遇到任何问题,请务必查看我们的常见问题。有关为 AMD ROCm 编写扩展的博客可在此处找到。